নতুন মিস্টার নিনজা ফাইটার গেমটিতে আপনি প্রাচীন জাপানে যাবেন এবং ডাকাতদের দলগুলির বিরুদ্ধে সাহসী নিনজা যুদ্ধে সহায়তা করবেন। আপনার চরিত্রটি দেশের প্রত্যন্ত প্রদেশে যেতে হবে এবং সেখানে অপরাধীদের সমস্ত দলকে ধ্বংস করতে হবে। স্ক্রিনে আসার আগে আপনার তরোয়াল দিয়ে সজ্জিত চরিত্রটি দৃশ্যমান হবে। সে পথ ধরে এগিয়ে যাবে। তার পথে পৃথিবীতে বিভিন্ন ফাঁদ পড়ে এবং জাল পড়ে। আপনার চরিত্রটি সমস্তের উপরে ঝাঁপিয়ে উঠতে আপনাকে আপনার নিয়ন্ত্রণ কীগুলি ব্যবহার করতে হবে। শত্রুর সাথে সাক্ষাত করার সময়, তাকে তরোয়াল দিয়ে আঘাত করুন এবং শত্রুকে ধ্বংস করুন।