গোপন এজেন্ট জোনি বিভিন্ন শত্রু সামরিক স্থাপনায় অনুপ্রবেশ এবং সেখান থেকে গোপনীয় ঘটনা চুরি করার আদেশ পেয়েছিল। গেমটিতে আপনি জনি মেগাটোনকে এই দুঃসাহসিক কাজে আমাদের নায়ককে সহায়তা করতে হবে। আপনার নায়ক বিভিন্ন অবস্থানের মধ্য দিয়ে যেতে হবে। তার পথে বিভিন্ন ফাঁদ এবং বাধা অবস্থিত হবে। নিয়ন্ত্রণ কীগুলি ব্যবহার করে, আপনাকে আপনার নায়ককে জালগুলির কিছু অংশে ঝাঁপিয়ে পড়তে বাধ্য করতে হবে, বা তাকে এড়াতে বাধ্য করতে হবে। আপনি যদি কোনও শত্রুর সাথে দেখা করেন তবে আপনি তাদের সাথে যুদ্ধে যোগ দেবেন এবং তা ধ্বংস করবেন।