জলদস্যুরা সবাইকে পেয়ে যায় এবং এমনকি নিনজা তাদের ধৈর্য হারিয়ে ফেলে এবং অহংকারী সমুদ্র ডাকাতদের শাস্তি দেওয়ার সিদ্ধান্ত নেয়। নিনজাদের একটি দল দ্বীপগুলির একটিতে একটি অ্যামবুশ স্থাপন করে যেখানে জলদস্যুরা তাদের চুরি করা ধন লুকানোর জন্য পর্যায়ক্রমে তাকায়। অ্যাংরি নিনজা গেমটিতে আপনি নিনজাকে জলদস্যুদের ধ্বংস করতে সহায়তা করবেন। ভিলেনরা দুর্গ গড়ে তোলার চেষ্টা করবে এবং তাদের পিছনে লুকিয়ে থাকবে, কিন্তু আপনার সঠিক শটগুলি তাদের পথের সমস্ত কিছু দূর করে দেবে। অ্যাংরি নিনজা গেমটি অ্যাংরি বার্ডের শৈলীতে তৈরি করা হয়েছে, তবে তাদের এবং শূকরের পরিবর্তে সম্পূর্ণ ভিন্ন চরিত্র। নিনজা নিজেই প্রজেক্টাইল হয়ে যাবে, এবং আপনি এগুলিকে জলদস্যুদের কাছে লঞ্চ করবেন যারা অ্যাংরি নিনজাতে বিভিন্ন ধরণের বিমের পিছনে লুকিয়ে ছিল।