সুপার মারিও ফ্ল্যাশ 2-এ মারিওর অ্যাডভেঞ্চার অব্যাহত রয়েছে। প্রিন্সেস পীচকে বাঁচানোর জন্য তার আগের মিশন সফল হয়েছিল, কিন্তু নায়ককে তার খ্যাতির উপর বেশিক্ষণ বিশ্রাম নিতে হয়নি। দরিদ্র রাজকন্যাকে আবার অপহরণ করা হয়েছিল এবং এবার এটি একটি ড্রাগন দ্বারা করা হয়েছিল। তিনি বন্দীকে টাওয়ারে রাখেন এবং মাশরুম রাজ্যের কাছ থেকে সম্পূর্ণ জমা দেওয়ার দাবি করেন। মারিও তখনও বিশ্রামের সময় পায়নি, কিন্তু আবার রাস্তায় চলে গেল। এই সময় তাকে আরও শত্রুদের মুখোমুখি হতে হবে, তারা দলে দলে আক্রমণ করবে। সুপার মারিও ফ্ল্যাশ 2 এ আপনি আপনার শত্রুদের মাথায় ঝাঁপিয়ে পড়ার সাথে সাথে দ্রুত এবং চটপটে হন।
