টম নামে একজন লোক একটি পুরানো পরিত্যক্ত স্কুলে প্রবেশ করেছিল এবং নিজেকে মারাত্মক বিপদে পড়েছিল। নানী নামে এক পাগলের নানী স্কুলে বসতি স্থাপন করেন। এখন গ্র্যানি'স ক্লাসরুম নাইটমেয়ার গেমটিতে আপনাকে লোকটিকে স্কুল থেকে পালাতে এবং বেঁচে থাকতে সাহায্য করতে হবে। আপনার চরিত্রকে নিয়ন্ত্রণ করে, আপনাকে গোপনে স্কুলের প্রাঙ্গনে যেতে হবে, সর্বত্র ছড়িয়ে ছিটিয়ে থাকা বিভিন্ন দরকারী আইটেম সংগ্রহ করতে হবে। নানী স্কুলের চারপাশে ঘুরে বেড়াচ্ছে এবং আপনাকে তার কাছ থেকে লুকিয়ে থাকতে হবে। যদি সে আপনাকে লক্ষ্য করে তবে সে আপনাকে ধরবে এবং আপনার চরিত্রটি মারা যাবে। আপনার নায়ক স্কুল ছেড়ে যাওয়ার সাথে সাথে আপনি গ্র্যানি'স ক্লাসরুম নাইটমেয়ার গেমটিতে পয়েন্ট পাবেন।
