নিনজা ছেলেটি তার শিক্ষককে প্রমাণ করতে চায় যে সে গুরুতর চ্যালেঞ্জের জন্য প্রস্তুত এবং তাকে দায়িত্বশীল কাজগুলি অর্পণ করা যেতে পারে। নিনজা বয় ফ্লাইং গেমটিতে, তিনি গোপনে ডাকাত এবং সমস্ত ধরণের অপরাধী উপাদান দ্বারা অধ্যুষিত একটি বিপজ্জনক এলাকায় গিয়েছিলেন। নায়ক এটিকে গতিতে চালাতে চায় এবং যেখানে বিস্তৃত বাধা অতিক্রম করা প্রয়োজন সেখানে তিনি একটি গ্লাইডিং ফ্লাইট ব্যবহার করবেন। শত্রুরা আপনার দিকে ছুটে আসবে এবং আপনি হয় তাদের উপর ঝাঁপিয়ে পড়তে পারেন বা শুরিকেন-এর তীক্ষ্ণ প্রান্ত সহ একটি স্টিলের তারার নিপুণ নিক্ষেপের মাধ্যমে তাদের নির্মূল করতে পারেন। আপনাকে বাধাগুলির প্রতি দ্রুত প্রতিক্রিয়া জানাতে হবে এবং নিনজা বয় ফ্লাইং-এ কীভাবে তাদের কাটিয়ে উঠতে হবে তা আরও দ্রুত সিদ্ধান্ত নিতে হবে।